自动化与智能制造学院（以下简称“学院”）始终瞄准国际学术前沿，围绕“控制科学与工程”“智能制造工程”两大主干学科，面向国家重大需求和重大科学问题开展前沿基础研究与应用基础研究。研究领域涵盖先进控制理论方法与应用、多智能系统、人工智能与机器学习、机器人技术、网络化系统、移动通信、分布式优化、人工智能背景下的先进复合材料设计与制造、智能系统设计与优化、智能交互与产品设计等。

截至2025年6月，学院已累计承担纵向及横向科研项目218项，项目经费逾1.7亿元。包括国家自然科学基金基础科学中心、联合基金重点支持项目、原创探索项目、资深外国学者项目、国家重点研发计划课题等国家级项目52项；广东省重点实验室、广东省重点领域研发计划、广东省国际科技合作项目、广东省自然科学基金项目等省部级项目30项；深圳市重点实验室、深圳市高层次人才团队、深圳市基础研究重点项目等市级项目34项；以及校企联合实验室、校企横向合作项目等97项，合作方包括华为、中兴、大疆、南方电网、中国核电工程有限公司、中国煤矿机械装备有限责任公司、广东生益科技股份有限公司等知名企事业单位。

截止2024年，学院在国际知名学术期刊/会议发表署名南科大的论文799篇，其中IEEE汇刊论文228篇、SCI论文515篇；申请专利174件，授权专利36件。科研成果获得教育部“中国高等学校十大科技进展”入选项目、安徽省科技进步奖二等奖、北京市科学技术进步奖二等奖、中国电子学会科学技术奖一等奖、中国发明协会发明创业奖创新奖一等奖、卫星导航定位科技进步一等奖、中国计算机学会科学技术奖一等奖、中国通信学会科学技术奖一等奖等奖励。

刘德荣讲席教授、李洪飞助理教授当选科睿唯安2023、2024年度“全球高被引科学家”；段广仁院士、林志赟院士、刘德荣院士当选2023、2024年度爱思唯尔(Elsevier)“中国高被引学者”，袁伟杰助理教授入选2024年度爱思唯尔(Elsevier)“中国高被引学者”。